لا يجب الاعتماد على استخدام المضادات الحيوية للأطفال عند كل إصابة؛ إذ تستخدم المضادات الحيوية فقط لعلاج الالتهابات والعدوى البكتيرية، ولا تجدي نفعًا في علاج العدوى الفيروسية أو الفطرية مثل نزلات البرد أو الإنفلونزا.
قد يسبب الإفراط في تناول المضادات الحيوية آثارًا جانبية كثيرة، مثل الإسهال أو الطفح الجلدي، كما أنه يقتل البكتيريا النافعة في الجهاز الهضمي، وقد يؤدي أيضًا إلى مقاومة المضادات الحيوية، مما يجعل علاج العدوى في المستقبل أكثر صعوبة، لذلك، يجب عدم استخدام المضاد الحيوي إلا بعد استشارة الطبيب.